Un estudio dirigido por investigadores del Centro Médico de la Universidad de Vanderbilt (VUMC) y de la Facultad de Farmacia de la Universidad de Arizona ha generado el primer catálogo completo de enfermedades, con enfermedades asociadas a variaciones en los genes del antígeno leucocitario humano (HLA) que regulan el sistema inmunitario del organismo.
El catálogo de enfermedades podría ayudar a identificar a individuos con riesgo de padecer ciertas enfermedades autoinmunes o que puedan generar anticuerpos que ataquen sus propios tejidos en respuesta a una infección.
El informe, publicado en el número de esta semana de la revista Science Translational Medicine, respalda el poder de las historias clínicas electrónicas (HCE) para avanzar en la comprensión, el tratamiento y, en última instancia, la prevención de las enfermedades, dijo el autor principal Joshua Denny, M.D., M.S., profesor de Informática Biomédica y Medicina en Vanderbilt.
El informe confirmó una serie de asociaciones descritas previamente e identificó algunas nuevas asociaciones potenciales. "De un plumazo hemos replicado décadas de investigación sobre asociaciones autoinmunes con el HLA", dijo Jason Karnes, doctor en Farmacia y coautor del artículo junto con Lisa Bastarache, doctora en Ciencias.
Los investigadores publicaron el catálogo de enfermedades en línea en http://www.phewascatalog.org. "Que yo sepa, ninguna otra investigación ha puesto este nivel de datos a disposición" de la comunidad investigadora en general, afirmó Karnes.
Karnes es profesor adjunto en la Facultad de Farmacia de la Universidad de Arizona, en Tucson. Contribuyó al estudio como antiguo becario postdoctoral en Farmacología Clínica en Vanderbilt. Bastarache es el principal científico de datos del Centro de Medicina de Precisión de Vanderbilt, que dirige Denny.
Los HLA (antígenos leucocitarios humanos) son proteínas que se expresan en la superficie de las células y que, como etiquetas con su nombre, permiten al sistema inmunitario distinguir los tejidos "propios" del organismo de los "no propios", como los patógenos invasores.
Las variaciones individuales en los genes HLA también se han relacionado con reacciones adversas a fármacos, rechazo de órganos trasplantados y enfermedades autoinmunes como la diabetes tipo 1 y la artritis reumatoide, en las que el sistema inmunitario confunde el tejido normal con un invasor extraño y lo ataca.
Estudios anteriores han identificado asociaciones entre el sistema HLA y "fenotipos" individuales, como enfermedades autoinmunes y de otro tipo, síntomas y otras características. La investigación actual -denominada "estudio de asociación de todo el fenoma" o PheWAS- escaneó el "fenoma" completo de los pacientes de todas las características de salud anotadas en la HCE.
En estudios anteriores sólo se había estudiado una o unas pocas enfermedades a la vez. Al estudiar muchas enfermedades a la vez, este estudio pudo demostrar que muchos tipos de HLA afectan a múltiples enfermedades, pero de distintas maneras. Por ejemplo, algunos tipos de HLA sitúan a una persona en riesgo tanto de diabetes tipo 1 como de artritis reumatoide, mientras que otros la sitúan en riesgo de diabetes tipo 1 pero protegida frente a la artritis reumatoide.
El estudio fue posible gracias a las bases de datos de ADN mantenidas en el VUMC y el Proyecto de Investigación de Medicina Personalizada de la Clínica Marshfield en Marshfield, Wisconsin. Hasta la fecha, se han almacenado más de 230.000 muestras de diferentes individuos en BioVU, la enorme base de datos de ADN de Vanderbilt. Las muestras genéticas están vinculadas a las correspondientes HCE en las que se ha suprimido la información identificativa para proteger la intimidad del paciente.
A partir del código genético, los investigadores dedujeron qué HLA se esperaría que se expresaran en casi 29.000 individuos cuyas muestras de ADN estaban almacenadas en BioVU y en otras 8.400 muestras proporcionadas por el doctor Scott Hebbring y sus colegas de la Clínica Marshfield.
Se analizaron las HCE de estos individuos para detectar la presencia de casi 1.400 fenotipos diferentes que pudieran relacionarse con los genes HLA.
La diabetes tipo 1 fue la asociación HLA más fuerte descrita previamente y confirmada por el estudio, pero los investigadores también hallaron pruebas de varias asociaciones potenciales nuevas con la esclerosis múltiple y el cáncer de cuello de útero. Se sabe que este último se debe a una infección vírica.
Se cree que las personas con determinadas variantes del HLA pueden -en respuesta a una infección, por ejemplo- generar anticuerpos que ataquen sus propios tejidos, señaló Denny. Esto sugiere que ciertas enfermedades autoinmunes podrían prevenirse en personas de alto riesgo identificando y tratando primero sus coinfecciones, dijo.
Denny dirige el Centro de Datos e Investigación del programa federal All of Us Research Program, antes llamado Precision Medicine Initiative Cohort Program, que está reclutando a un millón o más de estadounidenses para un estudio histórico sobre los factores genéticos, ambientales y de estilo de vida que afectan a su salud.
"Imagínese lo que podremos hacer con un millón de personas", afirma. "Eso producirá catálogos realmente exhaustivos de todos estos tipos de asociaciones a través de HLA y todo lo demás. El detalle con el que podremos resolver estas cuestiones será asombroso".
Fuente: http://www.dddmag.com/news/2017/05/scientists-create-unique-disease-catalog-linked-immune-system-gene-variations
Fecha: 05/12/2017