Analizar el metagenoma ayuda a comprender el papel de las especies bacterianas en la enfermedad de Crohn's

El análisis del metagenoma ayuda a comprender el papel de las especies bacterianas en la enfermedad de Crohn

La enfermedad de Crohn es una grave enfermedad inflamatoria intestinal muy extendida en los países desarrollados. Entre sus posibles factores causales se encuentran la predisposición genética, el entorno y el estilo de vida de los pacientes. La enfermedad está asociada a una reacción anormal del sistema inmunitario a los microbios intestinales propios de la persona; la disbiosis intestinal es típica. Para estudiar su evolución y encontrar métodos de diagnóstico y tratamiento eficaces, los científicos exploran el papel de las bacterias en el proceso patológico.

Uno de los enfoques más prometedores es el análisis metagenómico. secuenciación del material genético total de una comunidad microbiana. Un equipo de investigación formado por científicos de la Universidad ITMO y especialistas del Centro Federal de Investigación y Clínica de Medicina Físico-Química, en colaboración con clínicos de varios centros médicos, ha investigado recientemente el metagenoma intestinal de pacientes con enfermedad de Crohn. Se descubrió que la composición de la microbiota de dichos pacientes es significativamente diferente en comparación con la de los sujetos sanos: a medida que disminuye la fracción de microbios normales, comienzan a dominar las especies patógenas que no son prevalentes en los seres humanos.

Ilustración de los síntomas y efectos de la enfermedad de Crohn

Aunque el tipo de disbiosis variaba de un paciente a otro, la mayoría de ellos manifestaban un aumento varias veces superior de la abundancia de Escherichia coli. Los científicos se propusieron identificar los genes específicos que distinguen los subtipos de Escherichia coli que habitan en el intestino de pacientes con enfermedad de Crohn y Escherichia coli que existe en las personas sanas. La comparación realizada con la población rusa demostró la ausencia de tales diferencias universales. Las observaciones se confirmaron durante el análisis de los conjuntos de datos disponibles públicamente sobre sujetos sanos y pacientes con enfermedad de Crohn de todo el mundo.

Escherichia coli se considera uno de los microbios intestinales más estudiados y fue también uno de los primeros en descubrirse. Su mayor abundancia en el intestino se observa en varias enfermedades. Nuestro análisis metagenómico demostró que el contenido genético de los microbios asociados a la enfermedad de Crohn Escherichia colivaría ampliamente, a pesar de la creencia existente de que sólo existen algunas variedades específicas. Los resultados apoyan el concepto de que la enfermedad de Crohn es un síndrome, es decir, una enfermedad en la que manifestaciones similares en múltiples casos están causadas por factores diferentes en cada uno de ellos", comenta Alexander Tyakht, investigador asociado de la Universidad ITMO.

La investigación indicó que varias cepas de Escherichia coli pueden coexistir en un intestino humano. Dado que cepas con genomas distintos pueden desempeñar funciones ecológicas significativamente diferentes, los mismos esquemas de tratamiento pueden tener un efecto distinto en cepas diferentes. Este descubrimiento ofrece la oportunidad de mejorar el equilibrio de la microbiota intestinal en pacientes con enfermedad de Crohn, mientras que el análisis personalizado del genotipo bacteriano brinda la oportunidad de seleccionar los medicamentos, probióticos e incluso donantes de trasplante masivo de materia fecal (TMPF) más eficaces para cada paciente.

Estos resultados también coinciden con las investigaciones anteriores de los científicos, que incluyeron el análisis del genoma de células aisladas del virus de la inmunodeficiencia humana (VIH). E. coli cepas. Los nuevos resultados arrojan luz sobre cómo cambia la microbiota en pacientes con enfermedad de Crohn y qué especies y cepas de bacterias participan en su desarrollo. Esto, a su vez, puede ayudar a comprender mejor el inicio y la evolución de la enfermedad, así como a optimizar los métodos de tratamiento.

Fuente: www.dddmag.com

Presentado por Fomat Medical

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