Resumen de la investigación sobre el metagenoma intestinal
Investigación sobre el metagenoma intestinal de pacientes con Enfermedad de Crohn aclara cómo influye en la composición taxonómica y funcional de la microbiota intestinal. Entre los cambios más comunes se encuentran la disminución de la diversidad de microbios beneficiosos y el aumento de la abundancia de Escherichia coli y otros microbios asociados con la inflamación. Los resultados pueden ayudar a comprender mejor las causas y la evolución de la enfermedad, así como a optimizar los esquemas de tratamiento. Los resultados se publicaron en BMC Genomics.
¿Qué es la enfermedad de Crohn?
La enfermedad de Crohn es una enfermedad inflamatoria intestinal grave muy extendida en los países desarrollados. Entre sus posibles factores causantes se encuentran la predisposición genética, el entorno y el estilo de vida de los pacientes. La enfermedad está asociada a una reacción anómala del sistema inmunitario ante las propias bacterias intestinales de la persona; la disbiosis intestinal es típica. Con el fin de estudiar su evolución y encontrar métodos de diagnóstico y tratamiento eficaces, los científicos investigan el papel de las bacterias en el proceso patológico.
¿Qué es el análisis metagenómico?
Entre los enfoques más prometedores se encuentra el análisis metagenómico. secuenciación del material genético total de una comunidad microbiana. Un equipo de investigación formado por científicos de la Universidad ITMO y especialistas del Centro Federal de Investigación y Clínica de Medicina Físico-Química, en colaboración con médicos de varios centros médicos, ha investigado recientemente el metagenoma intestinal de pacientes con enfermedad de Crohn. Se descubrió que la composición de la microbiota en estos pacientes es significativamente diferente a la de los sujetos sanos: a medida que disminuye la proporción de microbios normales, comienzan a predominar especies patógenas que no son prevalentes en los seres humanos.
Aunque el tipo de disbiosis variaba de un paciente a otro, la mayoría de ellos manifestaban un aumento considerable en la abundancia de Escherichia coli. Los científicos se propusieron identificar los genes específicos que distinguen los subtipos de Escherichia coli que habitan en el intestino de los pacientes con enfermedad de Crohn y la Escherichia coli común que existe en las personas sanas. La comparación realizada en la población rusa mostró una falta de diferencias universales. Las observaciones se confirmaron durante el análisis de los conjuntos de datos disponibles públicamente sobre sujetos sanos y pacientes con enfermedad de Crohn de todo el mundo.
“La Escherichia coli se considera una de las bacterias intestinales más estudiadas y también fue una de las primeras en descubrirse. Se ha observado un aumento de su abundancia en el intestino en varias enfermedades. Nuestro análisis metagenómico mostró que el contenido genético de la Escherichia coli asociada a la enfermedad de Crohn varía ampliamente, a pesar de la creencia existente de que solo hay algunas variedades específicas. Los resultados respaldan el concepto de que la enfermedad de Crohn es un síndrome, es decir, una enfermedad en la que manifestaciones similares en múltiples casos son causadas por factores diferentes en cada caso”, comenta Alexander Tyakht, investigador asociado de la Universidad ITMO.
Escherichia coli y el intestino humano
La investigación indicó que varias cepas de Escherichia coli pueden coexistir en el intestino humano. Dado que las cepas con genomas diferentes pueden desempeñar funciones ecológicas muy distintas, los mismos esquemas de tratamiento pueden tener efectos diferentes en cepas diferentes. Este descubrimiento ofrece la oportunidad de mejorar el equilibrio de la microbiota intestinal en pacientes con enfermedad de Crohn, mientras que el análisis personalizado del genotipo bacteriano ofrece la oportunidad de seleccionar los medicamentos, probióticos e incluso donantes de trasplante de masa fecal (TMF) más eficaces para cada paciente.
Últimos resultados
Estos hallazgos también concuerdan con investigaciones anteriores de los científicos que incluyeron el análisis genómico de cepas aisladas de E. coli. Los nuevos resultados arrojan luz sobre cómo cambia la microbiota en pacientes con enfermedad de Crohn y qué especies y cepas de bacterias participan en su desarrollo. Esto, a su vez, puede ayudar a comprender mejor el inicio y el progreso de la enfermedad, así como a optimizar los métodos de tratamiento.
Fuente: www.dddmag.com
Presentado por Fomat Médico